Los avances recientes a nivel mundial en investigación científica y desarrollo industrial relacionados con la exploración de hidrógeno natural han promovido una evaluación preliminar a escala nacional del potencial de hidrógeno natural en Uruguay. Esta iniciativa es particularmente relevante dada la actual falta de conocimiento previo sobre el hidrógeno natural en Uruguay, tanto desde la perspectiva científica como gubernamental. Uruguay representa una región prometedora para la prospección de hidrógeno natural debido a la presencia de rocas fuente potenciales en su basamento precámbrico, incluyendo grandes volúmenes de hierro (BIFs), gabros, serpentinitas e intrusiones graníticas y volcánicas radiactivas. Además, la cobertura sedimentaria fanerozoica en sus cuencas sedimentarias continentales podría ofrecer condiciones favorables para la acumulación y atrapamiento de hidrógeno natural. Estudios recientes también han reportado ocurrencias de hidrógeno natural en regiones geológicamente vinculadas como el sur de Brasil y Namibia. Presentamos una revisión de las rocas fuente potenciales de hidrógeno natural en los afloramientos del basamento de Uruguay, incluyendo su ubicación, datos geoquímicos y principales características geológicas. Adicionalmente, se proponen las áreas de exploración más prometedoras en las Cuencas del Norte y Laguna Merín, con un análisis geológico prospectivo que define las rocas fuente, las rutas de migración, los reservorios y las rocas sello. Se definió un sistema de hidrógeno para cada área.