Las ciliopatías constituyen un grupo de enfermedades genéticas causadas por alteraciones en proteínas esenciales para la estructura y función de las cilias primarias, generando defectos en múltiples órganos y sistemas. Uno de ellos es el síndrome de Bardet-Biedl (BBS), el cual se origina por mutaciones en genes que codifican las proteínas del BBSoma, un complejo multiproteico involucrado en el transporte intracelular hacia la cilia. A pesar de los avances en el conocimiento de las funciones celulares de estas proteínas, los mecanismos que regulan su expresión génica permanecen poco comprendidos. El presente trabajo tuvo como objetivo estudiar la regulación transcripcional del gen bbs4 y de otros genes asociados al BBSoma durante el desarrollo embrionario de Danio rerio, utilizando embriones salvajes y portadores de una mutación nula en bbs4. Inicialmente, se observó una elevada variabilidad en los niveles de expresión de bbs4 mediante RT-qPCR, lo que motivó la optimización de los protocolos de extracción de ARN, retrotranscripción y obtención de embriones para minimizar la variabilidad técnica y biológica. Posteriormente, se analizaron embriones de distintos genotipos y estadios de desarrollo, observándose que los embriones heterocigotas mantienen niveles de expresión del alelo silvestre comparables a los de tipo salvaje, sugiriendo mecanismos de adaptación transcripcional frente a cambios en la dosis génica. Asimismo, se detectó la presencia del transcripto mutante en embriones heterocigotas y knock out, indicando una degradación parcial e incompleta del ARNm mutado. Además, se exploró la participación de la vía NMD y se analizaron otros genes BBS y factores de transcripción RFX. Los resultados sugieren que la regulación de los genes BBS es compleja e involucra mecanismos de compensación génica y posibles procesos de corregulación transcripcional durante el desarrollo embrionario.