El siguiente proyecto aborda la genómica comparativa y poblacional del género Catenibacterium, un grupo de bacterias anaerobias obligadas del microbioma intestinal humano cuyo rol funcional ha presentado evidencias contradictorias en diversos estudios de salud y enfermedad tanto en animales como en humanos. La investigación parte de la hipótesis de que esta variabilidad clínica es consecuencia de una diversidad genómica y estructural poco caracterizada, la cual incluye una distribución diferencial de grupos de genes biosintéticos con potencial antimicrobiano. El objetivo central del trabajo es caracterizar la estructura poblacional y la diversidad genómica del género mediante el análisis comparativo de su pangenoma para identificar compuestos antimicrobianos vinculados a su rol funcional. Para esto, se construyó una base de datos genómica global y diversa que integró 414 secuencias provenientes de repositorios públicos y de datos originales generados por el Laboratorio de Genómica Microbiana del Institut Pasteur de Montevideo. Tras un proceso de control de calidad, ensamblaje, binning y filtrado taxonómico, se seleccionaron 218 genomas y genomas ensamblados desde metagenomas de alta calidad para el análisis final. Los resultados permitieron identificar seis especies distintas dentro del género basándose en valores de identidad nucleotídica promedio y resultados de clasificación, siendo C. mitsuokai y C. mitsuokai_A las más prevalentes. El estudio incluyó la anotación funcional de los genomas, la determinación del pangenoma del género, y la búsqueda in silico de determinantes de actividad antimicrobiana mediante herramientas como antiSMASH, DeepBGC y BGC-Prophet. Todo el análisis se integró en un flujo de trabajo automatizado mediante Nextflow, asegurando la escalabilidad y reproducibilidad de los resultados obtenidos.