Tree species are vital to Agroforestry Systems (AFS), and selecting species that are suited to local conditions is essential for achieving this system’s objectives. In this study we characterized the phytophysionomies present in the Uruguayan-Brazilian Pampa Ecoregion in order to identify the most suitable species to include in AFS. In this sense we aimed to answer the following questions: i) Do the a priori defined phytophysionomies have a different species composition compared to the ecoregion? ii) Which environmental variables are related to species composition variation? iii) Which species are indicators of different phytophysiognomies? iv) Which native species are key for AFS implementation in these phytophysiognomies? We analysed floristic and environmental data from 106 sites across five phytophysiognomies using Non-metric Multidimensional Scaling (nMDS) and Analysis of Similarity (ANOSIM) and the Indicator Species Analysis (IndVal). Results revealed significant differences in species composition between the phytophysiognomies, indicating that the predefined formations have distinct species assemblages. Indicator Species Analysis IndVal identified 136 species, of wich 27 were prioritised for AFS use, contributing to a total of 84 priority native species, including those with multipurpose uses. These findings highlight the importance of considering local phytophysiognomies when planning AFS with native species in this ecoregion.

Espécies arbóreas são vitais para os Sistemas Agroflorestais (SAF), e a seleção das espécies adequadas às condições locais é essencial para atingir os objetivos desse sistema. Nesse estudo, as fitofisionomias presentes na Ecorregião do Pampa Uruguaio—Brasileiro foram caracterizadas a fim de identificar as espécies mais adequadas para uso em SAF. Assim, buscamos responder as seguintes questões: i) As fitofisionomias definidas a priori têm uma composição de espécies diferente em comparação com a ecorregião? ii) Quais variáveis ambientais estão relacionadas a variação na composição de espécies? iii) Quais espécies são indicadoras de diferentes fitofisionomias? iv) Quais espécies nativas são fundamentais para a implementação de SAFs nestas fitofisionomias? Analisamos os dados florísticos e ambientais de 106 locais em cinco fitofisionomias utilizando a Escala Multidimensional Não-Métrica (nMDS), a Análise de Similaridade (ANOSIM) e a Análise de Espécies Indicadoras (IndVal). Os resultados revelaram diferenças significativas na composição de espécies entre as fitofisionomias, indicando que as formações definidas a priori têm conjuntos de espécies distintos. A Análise de Espécies Indicadoras (IndVal) identificou 136 espécies, das quais 27 foram priorizadas para o uso do AFS, contribuindo para um total de 84 espécies nativas prioritárias, incluindo aquelas com múltiplos usos. Essas descobertas destacam a importância de considerar as fitofisionomias locais ao planejar o SAF com espécies nativas nessa ecorregião.