La separación y desvinculación entre las elecciones departamentales y nacionales, ocurrida luego de la reforma electoral de 1996 en Uruguay, modificó la forma en que los votantes participan electoralmente y provocó que los partidos obtengan desempeños diferentes en ambos niveles de competencia dentro de un mismo ciclo electoral. En este trabajo se indaga sobre los efectos que los cambios en las reglas electorales pueden tener sobre el comportamiento de los votantes a través de un estudio de caso: el departamento de San José en el período 1999-2010. Con el objetivo de explorar la incidencia del desempeño electoral de los partidos sobre el comportamiento de los votantes en las elecciones departamentales y asumiendo que la diferencia en los resultados se debe al cambio de preferencia y al voto estratégico en la elección departamental, se sostiene que la expectativa que tienen los votantes sobre el desempeño electoral de los partidos incide en su comportamiento. Como es probable que a nivel local existan como competidores principales, por un lado el Frente Amplio (FA) y por otro algún partido tradicional, se propone que las chances que tiene el FA de ganar la elección departamental determina el comportamiento electoral de los votantes. A través de los indicadores de volatilidad electoral y número efectivo de partidos, se describe la evolución electoral en San José y se analiza las tendencias electorales de los partidos en ambos niveles, antes y después de la reforma. Además se compara la volatilidad inter e intraciclo post-reforma y se analiza a través de artículos de prensa el comportamiento de dirigentes políticos en el ciclo 2009-2010. Se constataron dos tipos de comportamientos en los votantes de los partidos tradicionales: uno estratégico, agrupándose cuando el FA tiene chances de ganar la elección departamental y otro que responde a un cambio de preferencia, es decir ciudadanos que en la elección nacional votaron por algún partido tradicional y en la departamental apoyaron al FA. Por el contrario no se pudo determinar cuánto de la pérdida de votos del FA, cuando no tiene chances de ganar, corresponden a motivaciones estratégicas o de cambio de preferencia.