Este trabajo se enmarca en un esfuerzo nacional por conocer las poblaciones silvestres de Ilex paraguariensis en Uruguay, una especie nativa de alto valor ecológico, cultural y simbólico, cuyas poblaciones se restringen a ambientes marginales para la especie en el país. El estudio aporta una caracterización integral del estado poblacional, integrando análisis genéticos, ecológicos y espaciales. Los análisis indican que la diversidad genética no presenta una reducción marcada, a pesar del aislamiento y del bajo tamaño efectivo de las poblaciones, con variación entre poblaciones. Las estructuras demográficas revelan procesos de regeneración dispares, influidos por la topografía y condiciones ambientales, lo que evidencia que no todas las limitantes responden a presiones antrópicas directas, sino también a condicionantes abióticos propias de estos ambientes marginales. La integración de la dimensión genética, demográfica y ambiental permite comprender de manera más holística la situación de la especie y reconocer que su persistencia depende tanto de procesos ecológicos naturales como de las presiones por actividades humanas. Finalmente, el trabajo dialoga con estudios de percepción social realizados como complemento de esta tesis, que evidencian un amplio respaldo a la conservación de la especie. De este modo, este trabajo aporta elementos para la comprensión ecológica de poblaciones marginales. Pero también contribuye con insumos clave para orientar planes y políticas de conservación de Ilex paraguariensis en Uruguay, articulando el conocimiento biológico y social necesario para fundamentar futuras estrategias de gestión.