El maíz (Zea mays L.) es un cultivo ampliamente utilizado en el Uruguay y cuenta con una gran diversidad genética representada por variedades criollas conservadas ex situ e in situ –on farm por productores familiares. A partir del año 2003, con el ingreso del maíz transgénico MON810, el uso de cultivares genéticamente modificados se ha generalizado en el territorio nacional. Debido a las características reproductivas de la especie, los cultivares comerciales pueden transferir sus características transgénicas a variedades criollas por medio de la polinización cruzada lo que representa un problema para la conservación in situ - on farm. En este contexto, el objetivo del trabajo es caracterizar los niveles de contaminación con ADN transgénico de una colección de variedades criollas conservadas en Uruguay y generar insumos para establecer estrategias que promuevan la coexistencia entre cultivos transgénicos y variedades criollas. Se analizó e integró información correspondiente a 54 variedades criollas y 33 productores, proveniente de relevamientos etnobotánicos por medio de entrevistas semi estructuradas, caracterizaciones fenotípicas de espiga y grano, presencia/ausencia de ADN transgénico por medio de DAS-ELISA. Se utilizó la prueba exacta de Fisher para determinar la existencia de asociación entre la detección de ADN transgénico y características etnobotánicas y fenotípicas presentes en la base de datos utilizada. Se realizo un análisis de correspondencias múltiples (ACM) para visualizar de forma grafica la existencia o no de relaciones entre las variables analizadas en su conjunto y la presencia de ADN transgénico, utilizando el programa R 3.6.0+ en conjunto a los paquetes "readr” "FactoMineR” y "factoextra”.Del total de variedades analizadas (54), 21 obtuvieron un resultado de detección de ADN transgénico positivo (38%), correspondientes a 15 de los productores entrevistados, provenientes de todas las regiones del país representadas. Se detectaron diferencias según el uso principal, variedades destinadas al autoconsumo obtuvieron detecciones positivas en menor frecuencia que aquellas que se destinan al consumo animal. Productores que participan de organizaciones obtuvieron detecciones positivas en sus variedades en una frecuencia menor que aquellos que mencionan no tener lazos con ninguna organización de productores. Se necesita fomentar el flujo de información relevante para conservación in situ-on farm de la diversidad genética del cultivo de maíz, mejorar el acceso a herramientas de detección de ADN transgénico y generar un marco regulatorio que ayude a fomentar la coexistencia regulada entre sistemas de producción que utilicen cultivares transgénicos y variedades criollas.