Desarrollo de poblaciones de mapeo para uso y domesticación de recursos fitogenéticos nativos. Uruguay presenta una alta riqueza genética en número de especies y géneros, así como dentro de las especies. El uso de los recursos fitogenéticos depende del conocimiento que se tenga de ellos. Además, es importante conocer la arquitectura genética de los caracteres de interés para utilizarlos. Las poblaciones biparentales son la herramienta para comprender la arquitectura genética. La disponibilidad de tecnología en la generación de marcadores moleculares en especies no modelo aumenta la efectividad de las poblaciones biparentales. Ejemplos de especies bien caracterizadas son Paspalum dilatatum y Solanum commersonii. El objetivo de este trabajo es generar una población biparental de líneas endocriadas recombinante para P. dilatatum y valorizar y agregar información a una población biparental recombinante F1 de S. commersonii. Se utilizó descendencia por una semilla para generar la población de P. dilatatum, la cual fue fenotipada para fecha de floración y genotipada usando GBS. La población de S. commersonii fue fenotipada para resistencia a R. solanacearum y se desarrollaron marcadores moleculares a partir de secuencias de GBS. P. dilatatum mostró segregación transgresiva para fecha de floración y además se logró generar secuencias de GBS. Mientras tanto la población de S. comersonii mostró segregación para la resistencia a R. solanacearum y se desarrolló un conjunto de marcadores y el primer borrador del mapa de ligamiento para la especie. Ambas poblaciones representan un avance en la valorización y utilización de recursos genéticos nativos y representan un insumo para la generación de conocimiento. Fue posible aplicar técnicas de secuenciación de última generación lo cual consolida la posibilidad de desarrollar e incorporar grandes números de marcadores moleculares. Existen proyectos continuando el trabajo realizado, analizando, incorporando nueva información y mejorando la información ya existente.