Haemophilus influenzae tipo b y Streptococcus pneumoniae son agentes frecuentes de infecciones en niños, se encuentran entre los principales agentes causales de otitis, neumonía, sepsis y meningitis, afectando principalmente a menores de 5 años. Las vacunas conjugadas para gérmenes encapsulados son una estrategia para aumentar la inmunogenicidad de las vacunas en los menores de 2 años. La introducción de las vacunas conjugadas contra Haemophilus influenzae tipo b y Streptococcus pneumoniae ha disminuido notoriamente en todos los países donde se utilizó, las distintas enfermedades causadas por estos gérmenes. Esto ha tenido un gran impacto en la salud sobre todo en edades pediátricas, disminuyendo drásticamente la morbi-mortalidad generada por las enfermedades invasivas por estos gérmenes. Sin embargo, se han observado fallas de estas vacunas en diversas poblaciones. Se realizó una revisión bibliográfica, en busca de las posibles causas que pudieran explicar estas fallas. De los artículos revisados surge que los niños que presentan fallos vacunales a Haemophilus influenzae tipo b tienen más frecuentemente comorbilidades que la población general, se describen entre las mismas la prematuridad, inmunodeficiencias primarias, infección por VIH, Síndrome de Down o neoplasias. Sin embargo, se describe que la mayoría de los niños no presentaba antecedentes patológicos, y que los estudios inmunológicos fueron normales. De las diversas preparaciones vacunales disponibles para Haemophilus influenzae tipo b la asociación con el antígeno de Bordetella pertussis acelular ha demostrado ser menos inmunógena y es actualmente desaconsejada. La vacunación con vacunas conjugadas para Streptococcus pneumoniae es más reciente y hay menos publicaciones sobre fallos de la misma. Se han identificado dos serotipos, el 6B y el 19F , que explican hasta el 60% de los fallos vacunales para esta bacteria. Por último se describe como causa de fallo vacunal la incorrecta administración de la vacuna o falla en vacunar.