La pérdida de la autotolerancia por parte del sistema inmune genera respuestas aberrantes contra el propio organismo, lo que está en la base patogénica de las enfermedades autoinmunes (EA). En particular, el Lupus Eritematoso Sistémico (LES) es una enfermedad autoinmune sistémica con alta prevalencia, que presenta problemas diagnósticos importantes y aún no tiene un tratamiento curativo. El transcriptoma humano incluye una amplia gama de ácidos ribonucleicos que no codifican para proteínas (ncRNAs). Estas moléculas, o sus fragmentos, han sido descritos a nivel extracelular como moléculas circulantes en el plasma. Desde entonces, la comunidad científica se ha interesado en la detección de estos ncRNAs en distintos biofluidos, con la finalidad de establecer a estas moléculas como analitos identificables en biopsias líquidas mínimamente invasivas, ya que podrían facilitar el diagnóstico, seguimiento y predicción la evolución de distintas enfermedades. Distintos ncRNAs han sido reportados alterados en la circulación de pacientes con LES, y por lo tanto han sido propuestos como prometedores biomarcadores de la enfermedad a través de su detección en biopsias líquidas. En esta tesis se secuenciaron pequeños RNAs de muestras de plasma de 3 pacientes con LES en actividad, 3 pacientes con LES en remisión y 3 controles sanas. Los resultados obtenidos sugieren la existencia de un perfil de miRNAs asociados a la actividad del LES. De este perfil de miRNAs, planteamos que la detección conjunta de miRNAs cuya expresión está aumentada en las pacientes activas, podría contribuir a mejorar el diagnóstico y seguimiento de la enfermedad. Los resultados de esta tesis son un punto de partida para futuros ensayos en los que se buscará validar estos resultados y continuar explorando el potencial de miRNAs como biomarcadores en biopsias líquidas mínimamente invasivas. Además, observamos una disminución de dos miRNAs – miR-150 y miR-106b – específicos de linfocitos B en las pacientes activas. Este resultado es interesante, ya que sus fluctuaciones ya han sido asociadas a procesos relevantes para la patología del LES, como ser la pérdida de la autotolerancia.