Existen numerosos mixosporidios parásitos de peces, dentro de los cuales el género Myxobolus ha sido descrito parasitando al sábalo (Prochilodus lineatus) en el Río Paraná, por varios autores en Brasil. En el presente trabajo el objetivo fue identificar la presencia de Myxobolus sp en P. lineatus del Río Uruguay y Río de la Plata. Se estudiaron 66 P. lineatus recolectados en su mayoría en la costa de Colonia del Sacramento, de los cuales 19 resultaron parasitados (28.8 % de prevalencia); 13 de ellos presentaron los quistes de parásitos en las branquias y 6 en las aletas. En los frotis realizados de los quistes, se encontró gran concentración de myxosporas, caracterizadas por un cuerpo oval que contiene 2 capsulas polares, unidas en el plano de sutura, que son identificadas dentro del género Myxobolus. Al estudiar la morfometría de los parásitos se observó la existencia de dos tipos de esporas: las de menor tamaño, que se encontraron en branquias y en aletas, corresponden a Myobolus porofilus, mientras que las de mayor tamaño, que se encontraron solamente en branquias, no se corresponden con las especies descritas de Myxobolus, por lo que posiblemente se trate de una nueva especie. Este nuevo parásito encontrado puede ser utilizado como bioindicador de la población de sábalos del Río Uruguay y Río de la Plata.