La población uruguaya se formó a partir de diversos procesos demográficos que involucraron aportes indígenas, africanos y europeos. Entre las corrientes migratorias europeas, la inmigración vasca tuvo una participación destacada, especialmente durante el siglo XIX. El objetivo general de este trabajo fue analizar la variabilidad genética paterna de una muestra de hombres uruguayos que se autoidentifican como descendientes de vascos y evaluar su similitud con poblaciones actuales del País Vasco. La muestra estuvo constituida por 26 varones uruguayos que se autoidentificaron como descendientes de inmigrantes vascos. Se analizaron 27 marcadores Y-STR mediante el sistema Yfiler™ Plus. Los haplogrupos fueron inferidos utilizando los programas HAPEST y NEVGEN. Asimismo, se estimaron frecuencias alélicas y parámetros de diversidad molecular, y se construyeron redes Median-Joining para explorar las relaciones genealógicas entre los haplotipos uruguayos y los correspondientes a las poblaciones de Álava, Guipúzcoa y Vizcaya. Los resultados mostraron una alta concordancia entre ambos predictores de haplogrupos (92,3 %) y un predominio del haplogrupo R1b (80,77 %), asignado al subclado R1b-M269 por NEVGEN. También se identificaron haplogrupos minoritarios E1b1b, I, G2a y J2b. Los análisis de diversidad evidenciaron una elevada variabilidad genética paterna, registrándose haplotipos distintos en los 26 individuos analizados. Las redes Median-Joining mostraron nodos compartidos entre individuos uruguayos y vascos, así como agrupamientos integrados por haplotipos de ambas poblaciones, lo que evidencia la existencia de haplotipos compartidos y una proximidad genética entre ambas poblaciones.