La composición de la microbiota tiene grandes implicancias en la salud humana y animal. En bovinos, se propuso que la composición de la microbiota del tracto reproductivo de las hembras condiciona el comportamiento reproductivo, la susceptibilidad a patógenos genitales y la salud de los animales neonatos. Estas hipótesis deben ser probadas a través del análisis de diferencias en la microbiota de casos y controles, para lo cual es importante contar con información de la microbiota del ganado sano. Este proyecto estuvo enfocado en analizar la composición de la microbiota vaginal bovina en relación al ciclo reproductivo. Mediante secuenciación masiva de un fragmento del gen 16S, se obtuvo un perfil taxonómico de la microbiota vaginal bacteriana de animales sanos. Los individuos se muestrearon en distintos momentos del ciclo reproductivo. Se comparó la composición de la microbiota de todos los animales para cada momento del ciclo, encontrándose grandes diferencias interindividuales. La composición de la microbiota al momento de la inseminación entre las vacas que resultan preñadas y las que no es significativamente diferente. Los resultados del proyecto serán una línea de base para el diseño de futuros proyectos que analicen la asociación entre la microbiota y el comportamiento reproductivo, lo cual podrá influir en mejorar la productividad de los rodeos.