El suelo es un recurso finito que aporta numerosos servicios ecosistémicos. Sin embargo, prácticas no sustentables han provocado la erosión del mismo afectando el rendimiento de los cultivos. De esta manera el concepto de salud del suelo ha tomado notoriedad en los últimos tiempos el cual se define como la capacidad del mismo de funcionar como un ecosistema vivo, sustentando las necesidades de plantas animales y humanos. Los microorganismos edáficos son considerados excelentes indicadores ya que cumplen un rol fundamental en el ciclado de nutrientes. Algunos ejemplos de indicadores microbiológicos utilizados son la abundancia de hongos y bacterias, carbono de la biomasa microbiana y actividades de enzimas como fosfatasa, ureasa y beta-glucosidasa responsables de la disponibilidad de nutrientes como fósforo, nitrógeno y carbono y la glomalina que mejora estabilidad de los agregados del suelo. Este trabajo busca evaluar el impacto del uso del suelo de diferentes agroecosistemas del Uruguay mediante indicadores microbiológicos.