En Uruguay el cultivo de arroz es una actividad de importancia económica y un sector clave en las exportaciones. Las Planicies del Este son una región propicia para su cultivo, de manera que allí se concentra una importante área destinada a este fin. En esa región se encuentran los pastizales del este, una comunidad vegetal particular, con alta prioridad para su conservación. El área con pastizales naturales ha ido decreciendo, entre otras cosas, por el cambio de uso del suelo hacia el uso arrocero. Desde el punto de vista ambiental, y en el marco de un escenario de cambio climático global, el cultivo inundado de arroz se caracteriza por emitir gases de efecto invernadero (GEIs). El presente proyecto tuvo como objetivo estudiar las poblaciones microbianas del suelo en las Planicies del Este, según este suelo esté bajo campo natural o bajo uso arrocero (durante el cultivo de arroz y durante la rotación con pastura sembrada). Una parte del proyecto se centró en el estudio general de las poblaciones microbianas (hongos y bacterias), mientras que otra se enfocó con más detalle sobre los microorganismos implicados en los balances de la emisión de dos importantes GEIs. Los principales resultados mostraron que los hongos son más abundantes en el campo natural mientras que las bacterias lo fueron en el arroz. Las poblaciones de hongos y bacterias también fueron diferentes entre el campo natural y aquellas parcelas bajo uso arrocero (arroz y pastura sembrada). Las poblaciones en las parcelas bajo arroz y aquellas bajo pastura sembrada no se diferenciaron entre sí, lo que indica que durante la fase de pastura la microbiota del suelo tiene similitudes con aquella que existe bajo la fase de arroz. Este mismo resultado se observa para muchas de las poblaciones de microorganismos y genes implicados en la emisión de GEIs.