Dilucidando el impacto del sistema inmune en el moldeado de genomas de arbovirus
Resumen:
Los arbovirus se mantienen en la naturaleza cumpliendo un ciclo entre un vertebrado y un vector artrópodo. Vertebrados y artrópodos están separados por más de seiscientos millones de años de evolución. Esta divergencia se manifiesta, por ejemplo, en importantes diferencias en sus sistemas inmunes. Para este trabajo se incluyeron diferentes arbovirus y virus específicos de insectos, y sus principales hospederos y/o vectores. A partir de abordajes computacionales hemos estudiado su composición genómica, donde se evidencian patrones distintivos entre ambos tipos de ciclos replicativos. Los pares de citosina y guanina unidos por enlaces fosfodiéster (CpG) son firmas genómicas relevantes. Los arbovirus están empobrecidos en CpG, en contraste con la alta frecuencia observada en virus que infectan exclusivamente insectos. Aún cuando los vectores artrópodos presentan heterogeneidad en sus frecuencias de CpG, las propiedades composicionales exhibidas por los arbovirus parecen estar determinadas por la presión del sistema inmune vertebrado. Recientemente se ha empezado a comprender el mecanismo de acción de la proteína antiviral con dedos de zinc ( ZAP ). En vertebrados se une preferentemente a regiones de ARN virales ricas en pares CpG. Al analizar nuestros resultados en conjunto, podemos afirmar que los artrópodos carecen de ortólogos de ZAP. Aun así, en sus proteomas encontramos parálogos de ZAP con funciones celulares diferentes a la de ZAP como PARP1, PARP5 y PARP16. Aunque se ha reportado actividad antiviral en varias de las proteínas de la familia PARP, queda mucho por entender sobre la evolución de esta familia multigénica y sus mecanismos de acción antiviral.
2022 | |
Agencia Nacional de Investigación e Innovación Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas Comisión Académica de Posgrado |
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Arbovirus Firmas genómicas Proteínas antivirales Sistema inmune Ciencias Naturales y Exactas Ciencias Biológicas Virología Biología y Biología de la Evolución |
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Español | |
Institut Pasteur de Montevideo | |
IPMON en REDI | |
https://hdl.handle.net/20.500.12381/3471 | |
Acceso abierto | |
Reconocimiento 4.0 Internacional. (CC BY) |
Sumario: | Los arbovirus se mantienen en la naturaleza cumpliendo un ciclo entre un vertebrado y un vector artrópodo. Vertebrados y artrópodos están separados por más de seiscientos millones de años de evolución. Esta divergencia se manifiesta, por ejemplo, en importantes diferencias en sus sistemas inmunes. Para este trabajo se incluyeron diferentes arbovirus y virus específicos de insectos, y sus principales hospederos y/o vectores. A partir de abordajes computacionales hemos estudiado su composición genómica, donde se evidencian patrones distintivos entre ambos tipos de ciclos replicativos. Los pares de citosina y guanina unidos por enlaces fosfodiéster (CpG) son firmas genómicas relevantes. Los arbovirus están empobrecidos en CpG, en contraste con la alta frecuencia observada en virus que infectan exclusivamente insectos. Aún cuando los vectores artrópodos presentan heterogeneidad en sus frecuencias de CpG, las propiedades composicionales exhibidas por los arbovirus parecen estar determinadas por la presión del sistema inmune vertebrado. Recientemente se ha empezado a comprender el mecanismo de acción de la proteína antiviral con dedos de zinc ( ZAP ). En vertebrados se une preferentemente a regiones de ARN virales ricas en pares CpG. Al analizar nuestros resultados en conjunto, podemos afirmar que los artrópodos carecen de ortólogos de ZAP. Aun así, en sus proteomas encontramos parálogos de ZAP con funciones celulares diferentes a la de ZAP como PARP1, PARP5 y PARP16. Aunque se ha reportado actividad antiviral en varias de las proteínas de la familia PARP, queda mucho por entender sobre la evolución de esta familia multigénica y sus mecanismos de acción antiviral. |
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