El manejo y conservación de los bosques nativos generan, hoy en día, innumerables discusiones a diferentes niveles (nacional, regional e internacional) y en diferentes ámbitos (político, social y académico), derivando en la elaboración de teorías y prácticas ecológicas, silviculturales, económicas, sociales y políticas de variados contenidos y alcances. Estas discusiones tienen, en su mayoría, su génesis en problemáticas asociadas a la tenencia de la tierra y al impacto del cambio climático. En Uruguay, el bosque nativo ha sido también objeto de múltiples debates, reflejados y sintetizados en la reciente publicación de una estrategia nacional para su conservación y su manejo (Dirección General Forestal (DGF), Ministerio Ganadería Agricultura y Pesca (MGAP), 2018). En todas estas instancias, los recursos genéticos forestales son pocas veces visualizados como una temática per se; se asimilan al concepto general de biodiversidad o se incluyen a los recursos fitogenéticos. En esta presentación, el abordaje de la situación actual de los recursos genéticos forestales en Uruguay se realiza desde ángulos ecológicos, económicos y sociales, estableciendo paralelos con las plantaciones forestales con especies exóticas de rápido crecimiento y relevando necesidades en investigación básica y aplicada. El trabajo se basa en búsquedas bibliográficas, revisiones de sitios Web de instituciones nacionales e internacionales y resultados propios de proyectos de investigación de más de una década del Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA). Los desafíos y perspectivas para el manejo y la conservación de los recursos genéticos forestales se centran básicamente en la identificación y el revelamiento de necesidades de investigación y en la factibilidad de su aplicación en el país.