RESUMEN.- El género de garrapatas Ixodes es considerado el más antiguo y diverso, con aproximadamente 279 especies. Dentro de este género, destacan las especies del complejo Ixodes ricinus que se han implicado en la transmisión de importantes enfermedades en humanos como la borreliosis de Lyme, anaplasmosis granulocítica humana y babesiosis. La babesiosis es causada por protozoarios del género Babesia y se considera una enfermedad zoonótica emergente a nivel mundial. El objetivo de este estudio fue caracterizar molecularmente las especies de Babesia en garrapatas I. fuscipes del norte de Uruguay. .........................ABSTRACT.- The genus Ixodes is considered the oldest and most diverse, with approximately 279 tick species. Within this genus, notable species of the Ixodes ricinus complex have been implicated in the transmission of significant human diseases such as Lyme borreliosis, human granulocytic anaplasmosis and babesiosis. Babesiosis is caused by protozoa of the genus Babesia and is considered an emerging zoonotic disease worldwide. The aim of this study was to molecularly characterize Babesia species present in I. fuscipes ticks from northern Uruguay.