La incorporación de especies estivales de metabolismo C4 a los sistemas pastoriles del Uruguay aportaría enormemente a la estabilidad ecológica del sistema. La especie con mayor potencial para cumplir ese rol es Paspalum dilatatum Poir o “pasto miel”. Sin embargo, tiene algunas limitantes para su adopción como la baja producción de semillas debido a su susceptibilidad a Claviceps paspali y la dormición de las mismas. El grupo Dilatata de Paspalum representa un complejo alopoliploide de especies, con sistemas reproductivos sexuales y apomícticos. Cinco tetraploides sexuales con fórmulas genómicas equivalentes IIJJ no presentan estas las limitantes por lo que son una gran reserva genética para el programa de mejoramiento de P. dilatatum. Los microsatélites son herramientas importantes para evaluar las mejoras genéticas del grupo. En el presente trabajo se estudió el modo de herencia y ligamiento de 15 marcadores microsatélites en una población F₆ desarrollada a partir de un cruzamiento entre P. dilatatum subsp. flavescens y P. dilatatum biotipo Virasoro. De acuerdo con resultados previos, se observó herencia disómica para todos los marcadores. 12 microsatélites mostraron una segregación distorsionada. En total, los alelos de P. dilatatum subsp. flavescens tuvieron más representación que los alelos de P. dilatatum biotipo Virasoro. Con la excepción de cinco marcadores, todos mostraron segregación mendeliana, sin ligamiento cercano, proporcionando información no redundante. Estos cinco marcadores se asignaron a dos grupos de ligamiento diferentes. Se agregó valor a esta herramienta, reuniendo un subconjunto de marcadores con el potencial para diferentes aplicaciones hacia el estudio y domesticación de P. dilatatum.