Evaluación de microsatélites utilizados para verificación de parentesco en 15 razas bovinas en Uruguay

Bianco Young, Carolina

Supervisor(es): Navajas, Elly - Macedo, Fernando - Peraza, Pablo

Resumen:

El objetivo de este trabajo fue evaluar un panel de 12 marcadores microsatélites (STR) recomendado por la ISAG para chequeos de paternidad en bovinos. Se analizaron un total de 21.040 genotipos (8.377 Aberdeen Angus, 6.990 Hereford, 2.791 Holando, 758 Aberdeen Angus puro controlado, 425 Jersey, 333 Normando, 290 Braford controlado, 228 Brangus preparatorio, 206 Limousin, 168 Wagyu, 142 Charolais, 108 Shorthorn, 91 Braford, 69 Brangus y 64 Brahman). Los datos fueron obtenidos de la base de datos de la Asociación Rural del Uruguay (ARU). Algunos de los STR evaluados presentaron bajo polimorfismo, reportándose valores de heterocigosidad y/o PIC inferiores a 0,5. La probabilidad de exclusión del panel de 12 marcadores no alcanzó valores mínimos recomendados en algunas de las situaciones evaluadas. La incorporación de 5 STR adicionales, mejoró dicha probabilidad, por lo cual el panel de 17 STR evaluado, supera los valores de probabilidad de exclusión de 0,9999 con excepción de la PEC1p. El posible uso de marcadores moleculares SNP como alternativa a los STR, podría implicar una mejora en la determinación de parentescos. Los resultados presentados son una base para futuras migraciones hacia otras tecnologías como SNP.


Detalles Bibliográficos
2017
BOVINOS
RAZAS
PATERNIDAD
REGISTROS GENEALOGICOS
URUGUAY
Español
Universidad de la República
COLIBRI
https://hdl.handle.net/20.500.12008/24944
Acceso abierto
Licencia Creative Commons Atribución - No Comercial - Sin Derivadas (CC - By-NC-ND 4.0)
Resumen:
Sumario:El objetivo de este trabajo fue evaluar un panel de 12 marcadores microsatélites (STR) recomendado por la ISAG para chequeos de paternidad en bovinos. Se analizaron un total de 21.040 genotipos (8.377 Aberdeen Angus, 6.990 Hereford, 2.791 Holando, 758 Aberdeen Angus puro controlado, 425 Jersey, 333 Normando, 290 Braford controlado, 228 Brangus preparatorio, 206 Limousin, 168 Wagyu, 142 Charolais, 108 Shorthorn, 91 Braford, 69 Brangus y 64 Brahman). Los datos fueron obtenidos de la base de datos de la Asociación Rural del Uruguay (ARU). Algunos de los STR evaluados presentaron bajo polimorfismo, reportándose valores de heterocigosidad y/o PIC inferiores a 0,5. La probabilidad de exclusión del panel de 12 marcadores no alcanzó valores mínimos recomendados en algunas de las situaciones evaluadas. La incorporación de 5 STR adicionales, mejoró dicha probabilidad, por lo cual el panel de 17 STR evaluado, supera los valores de probabilidad de exclusión de 0,9999 con excepción de la PEC1p. El posible uso de marcadores moleculares SNP como alternativa a los STR, podría implicar una mejora en la determinación de parentescos. Los resultados presentados son una base para futuras migraciones hacia otras tecnologías como SNP.