Introducción: La deserción estudiantil adolescente constituye un problema sanitario, socioeconómico y cultural. Existen escasos estudios nacionales que describan esta temática. Objetivo: Describir los factores asociados a la deserción estudiantil en adolescentes de 12 a 19 años que asisten a policlínicas de los centros de salud de: Jardines del Hipódromo, Badano Repetto y Centro Cívico Salvador Allende entre el 20 de agosto al 20 de setiembre de 2017. Metodología: Estudio descriptivo observacional mediante encuesta anónima. Se incluyeron todos los adolescentes de 12 a 19 años que asistieron a dichos centros y abandonaron el sistema educativo. Variables: edad, sexo, último año cursado, números de años repetidos, motivos de deserción, características del núcleo familiar, estímulo familiar y de pares. Resultados: contestaron 79% (64/81) adolescentes. La media de edad fue 17,2 años (rango 12 –19), de sexo femenino 60,9% (39/64). No completó ciclo básico 60,9%. Principales motivos de deserción reportados: falta de interés personal 43,8% (28/64), repetición 42,2% (27/64) y falta de interés por materias dictadas 32,80% (21/64). Refirieron repetir al menos un año 14/27, 2 veces 8/27. Motivos de repetición reportados: inasistencia 15/27, seguido por falta de interés 6/27. Consideraron importante el estudio para su futuro 82,8%. Refirieron contar con apoyo familiar 93,7%, y de sus pares 64,5%. Conclusión: la mayoría de los adolescentes encuestados no completó ciclo básico, las principales causas de deserción referidas fueron la falta de interés personal y la repetición. La deserción estudiantil adolescente es un problema multifactorial que requiere un abordaje interdisciplinario y transinstitucional.