El cultivo de frutilla se encuentra distribuido en dos zonas de importancia en Uruguay, en el Sur en los departamentos de Canelones y San José, y en el Norte, en Salto. El valor del cultivo en los sistemas prediales radica en el uso intensivo de recursos, fundamentalmente mano de obra y capital, generando altos márgenes de ganancia por unidad de superficie. Desde 2015, se ha observado una alta mortandad de plantas debido a enfermedades de raíz y corona producidas por un complejo de patógenos. Asociado a la muerte de plantas de frutilla en Salto, Cylindrocarpon spp. se aisló en una frecuencia de 42,4 % ocupando el tercer lugar en cuanto a incidencia. El objetivo de este trabajo fue caracterizar los aislados de Cylindrocarpon spp. mediante análisis molecular, morfológico y de patogenicidad en plantas de frutilla. Se caracterizaron molecular y morfológicamente seis aislados. A partir de ellos se inocularon 30 plantas de frutilla del cultivar INIA Guapa para probar su patogenicidad en cámara de crecimiento del Laboratorio de Fitopatología de Facultad de Agronomía, Universidad de la República (Montevideo). Las especies identificadas fueron Dactylonectria novozelandica, D. ecuadoriensis y D. macrodidyma. Los síntomas observados fueron necrosis en bordes de hojas y en la totalidad de estas, necrosis en los sistemas radiculares y lesiones incipientes en coronas como decoloraciones en la base de las mismas. De las plantas sintomáticas que se realizaron los re-aislamientos se recuperaron a partir de raíz y corona los hongos con los que fueron inoculadas. El presente trabajo es el primero en determinar la patogenicidad de D. novozelandica, D. ecuadoriensis y D. macrodidyma en frutilla. En base a las condiciones que se realizó el ensayo se identificaron las especies D. novozelandica, D. ecuadoriensis y D. macrodidyma causando necrosis de raíz y corona en frutilla, formando parte del complejo de patógenos que causan enfermedades de raíz y corona de frutilla en Uruguay.