El berberecho Donax hanleyanus y la almeja amarilla Mesodesma mactroides, especies subtropical y de aguas templado-frías, respectivamente, tipifican las playas arenosas del océano Atlántico Suroccidental, que presenta uno de los “hotspots” de calentamiento marino más fuertes a nivel mundial. Investigamos la conectividad larval de dichas especies usando un modelo individuo basado (IBM por su sigla en inglés) y evaluamos los efectos de la temperatura del agua en la conectividad. El IBM combinó salidas de un modelo hidrodinámico 3D con un sub-modelo para las almejas que consideró mortalidad larval por efectos de temperatura para cada especie, además se incluyó diferentes meses de liberación larval y duraciones del periodo larval en el plancton. En ambas especies, la conectividad a través del estuario del Río de la Plata ocurrió solo para larvas liberadas durante un evento La Niña intenso. Para M. mactroides, la mortalidad larval inducida por agua cálida redujo su conectividad, llevando a procesos de autoreclutamiento en la mayoría de las áreas. Para D. hanleyanus la mortalidad larval inducida por temperatura no afectó los patrones de conectividad. No hubo transporte larval hacia el límite sur de distribución de ambas especies, corroborando un patrón de reclutamiento irregular típico de poblaciones locales sumidero situadas en el borde del rango de distribución de ambas metapoblaciones. La aceleración del calentamiento en este “hotspot” podría restringir aún más la conectividad larval de las poblaciones de almeja en el Atlántico Suroccidental, con implicancias para la conservación de la especie que ha sufrido disminuciones de abundancia debido al calentamiento.