El virus del papiloma humano (HPV, por sus siglas en inglés) provoca una de las infecciones de transmisión sexual (ITS) más comunes a nivel mundial, caracterizada por su transmisión a través del contacto sexual, ya sea genital, anal u oral. Se han identificado más de 200 genotipos diferentes de HPV, los cuales se clasifican en dos categorías: los de alto riesgo y los de bajo riesgo. Los genotipos de alto riesgo son aquellos que están estrechamente asociados con el desarrollo de distintos tipos de cánceres, principalmente el cáncer de cuello uterino, aunque también pueden estar implicados en cánceres de ano, pene, vagina y orofaringe. Por otro lado, los genotipos de bajo riesgo están vinculados con la aparición de lesiones benignas, como las verrugas anogenitales. El estudio de la epidemiología del HPV permite comprender su distribución y prevalencia en diferentes poblaciones. Una de las estrategias emergentes para su monitoreo es el análisis de aguas residuales, una técnica que ha sido ampliamente utilizada en la vigilancia epidemiológica de diversos agentes infecciosos. Este enfoque, denominado epidemiología basada en aguas residuales (EBAR) permite detectar la presencia del virus en la población a partir de los virus excretados en las heces y la orina, brindando información sobre la circulación del virus sin requerir estudios individuales invasivos. El presente estudio tuvo como objetivo principal la detección y tipificación de los genotipos circulantes del HPV en las aguas residuales de la ciudad de Salto, Uruguay, con el fin de analizar su circulación en la población local. Para ello, se llevó a cabo la recolección de muestras mensuales durante un año en la entrada de la planta de tratamiento de aguas residuales de la ciudad. Posteriormente, se procedió a la concentración viral presente en las muestras y a la detección y cuantificación mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés). Los productos amplificados de ADN fueron sometidos a secuenciación masiva, lo que permitió determinar con precisión los genotipos presentes y analizar su distribución en la población salteña. Se detectó HPV en el 75% de las muestras, con un total de 28 genotipos identificados, incluyendo 9 de alto riesgo. El genotipo 66 fue el único presente en todas las estaciones del año, seguido por otros como el 6, 16 y 31, mostrando una diversidad y circulación variable según la estación. Estos resultados evidencian una circulación sostenida y diversa del HPV en la comunidad salteña. La metodología de vigilancia ambiental demostró ser eficaz para el monitoreo no invasivo del virus y constituye una herramienta valiosa para complementar estrategias de salud pública, especialmente en regiones con acceso desigual al sistema sanitario.