El objetivo de este trabajo fue evaluar el crecimiento de Cyprinus carpio y Australoheros facetus en sistemas acuapónicos con Nasturtium officinale y Mentha spp., comparándolo con un sistema de recirculación con filtro biológico. Se sembraron juveniles de ambas especies en seis tanques de 500 L, tres tanques para cada especie. En cada grupo de repeticiones, a dos tanques se le implementó un sistema acuapónico, uno con N. officinale y otro con Mentha spp., y el tercer tanque se preparó con un sistema de filtro biológico. Se evaluó crecimiento en longitud y peso, índice de conversión alimenticia y porcentaje de supervivencia de los peces para cada tratamiento, así como producción de biomasa vegetal de los tratamientos con acuaponia. Los resultados mostraron que C. carpio presentó mayor crecimiento y mejor índice de conversión alimenticia en acuaponia que en el sistema con filtro biológico, siendo superior en el tratamiento con Mentha spp. En el caso de A. facetus no hubo diferencias entre los distintos sistemas ni tratamientos. La supervivencia fue buena en todos los casos. Se obtuvo una adecuada producción de Mentha. spp y N. officinale en acuaponia. No se evidenciaron diferencias en la calidad del agua entre sistemas. En conclusión, la acuaponia mejoró el desempeño productivo de C. carpio pero no mostró dichos beneficios para A. facetus en el corto plazo evaluado. Los resultados sugieren el potencial de esta tecnología para incrementar los cultivos conjuntos de ciertas especies de peces y vegetales.