La Encefalopatía Espongiforme Bovina (EEB) se asocia con la nueva variante de la enfermedad de Creutzfeldt-Jacob de los humanos (a partir del consumo de animales infectados). Se ha transformado a la EEB en la enfermedad animal de mayor repercusión económica y social de la historia. Dos polimorfismos de tipo Inserción/deleción -indel- en la región no codificante del gen PRNP bovino han demostrado estar asociados con la susceptibilidad a la enfermedad, siendo las deleciones más frecuentes en los animales susceptibles. En este trabajo se estudió la distribución poblacional de ambos polimorfismos indel en la raza Aberdeen Angus de Uruguay. Se seleccionaron 648 animales de ambos sexos, provenientes de diferentes líneas genéticas del banco de ADN del Área Genética, FVET-UdelaR. Las muestras fueron genotipadas mediante la técnica de espectrometría de masa. En base a los genotipos obtenidos se realizó un análisis genéticopoblacional. Se calcularon proporciones genotípicas, alélicas, haplotípicas y diplotípicas para ambos marcadores. Se evaluó el equilibrio génico de Hardy-Weinberg, se calcularon los índices de diversidad FIS, HO, HE y se analizó el desequilibrio de ligamiento entre ambos marcadores (D´). Se observó para ambos polimorfismos una alta proporción de genotipos Del/Del así como una elevada proporción de los alelos de deleción. Para ambos marcadores la población se encontró en equilibrio génico de HardyWeinberg. Los índices de diversidad media fueron similares a los reportados en esta misma población por otros autores. Al considerar la distribución de haplotipos, el haplotipo Del23 / Del12 (asociado a mayor susceptibilidad) fue el más abundante, seguido del haplotipo In23 / In12. Ambos marcadores demostraron estar fuertemente ligados. Concordante con la distribución haplotípica, el diplotipo Del23Del12 / Del23Del12 fue el más frecuente seguido de Del23Del12 / In23In12. La dinámica poblacional de ambos polimorfismos en la población Aberdeen Angus de Uruguay es similar a la reportada para la raza en Brasil y Japón, así como en la mayoría de las razas Bos taurus estudiadas.