La otitis externa es una enfermedad inflamatoria, de etiología multifactorial, pudiendo ser aguda o crónica. Presenta alto porcentaje de recidivas, cronificando la enfermedad y llevando a tratamientos no efectivos. Esto sumado al avance de la resistencia bacteriana, genera la búsqueda de nuevas opciones de tratamiento. La ozonoterapia se presenta como una terapia alternativa al uso de antibióticos, sin haber microorganismos resistentes reportados hasta el momento. Presenta propiedades microbicidas, analgésicas y antiinflamatorias. Una de sus aplicaciones tópicas se realiza mediante el uso de aceites ozonizados, presentando un alto poder germicida debido a la peroxidación de lípidos y proteínas interrumpiendo la integridad de la envoltura celular bacteriana. Este trabajo tuvo como objetivo principal comparar la ozonoterapia tópica y el tratamiento convencional frente a otitis externas caninas. Para ello se formaron dos grupos de estudio al azar, cada uno conformado por 15 animales cursando otitis infecciosa externa. Al grupo control, se le realizó el tratamiento tradicional ótico tópico conteniendo gentamicina, ketoconazol, prednisolona y lidocaína. Mientras que al grupo de ozonoterapia se le administró aceite ozonificado tópico. En ambos grupos se administró además dipirona y dexametasona. A la totalidad de los animales se les realizó hisopados los días 1, 7 y 14 del tratamiento para evaluar su evolución. A todos los hisopados obtenidos se les realizó un frotis directo y posterior tinción de Gram para determinar la presencia de Malassezia spp. Además, se sembraron en medio Tripticasa Soya Agar (TSA) y se realizó la identificación primaria a nivel de género de las colonias crecidas. Posteriormente se realizaron aislamientos en medios selectivos para la identificación de los agentes actuantes, seguido de un análisis de susceptibilidad a los antibióticos in-vitro. Los resultados revelaron que los microorganismos detectados con mayor frecuencia en la totalidad de los aislamientos fueron Malassezia spp. (70%), Staphylococcus spp. (63%) y Pseudomonas spp. (20%). Otras bacterias encontradas en menor proporción fueron: Corynebacterium spp., enterobacterias y bacilos contaminantes. Se demostró que el tratamiento con ozono tópico fue más eficaz en comparación con el tratamiento con óticos de gentamicina en las otitis causadas por Staphylococcus spp y Malassezia spp cumplidos los 7 días de tratamiento. Asimismo, no se evidenció eficacia del ozono en las infecciones por Pseudomona spp. Por otro lado, a los animales con aislamientos de Staphylococcus spp y Malassezia spp que no mostraron evolución clínica favorable con gentamicina cumplidos los 7 días, se les aplicó el tratamiento con aceite ozonizado, evidenciando una evolución clínica favorable en el total de los casos en el mismo período de tiempo. Es necesario realizar futuros ensayos para determinar las causas de la falla en el tratamiento con ozono en las otitis causadas por Pseudomona spp. En el presente trabajo se observó diferencia significativa entre el uso tópico de gentamicina u ozono para el tratamiento de las otitis causadas por Staphylococcus spp., no siendo así para las causadas por Malassezia spp. Por tanto, debido a la creciente resistencia antimicrobiana se plantea el uso de aceite ozonificado como una estrategia efectiva para el tratamiento de otitis caninas externas infecciosas causadas por estos microorganismos.