Las plantas y los microorganismos han sido históricamente una fuente clave de metabolitos secundarios con aplicaciones terapéuticas, alimenticias y tecnológicas. Muchos de estos compuestos poseen propiedades antimicrobianas, entre ellos polifenoles, alcaloides, terpenoides y péptidos, que actúan mediante diversos mecanismos como la inhibición enzimática, la alteración de membranas o la interferencia en la síntesis de macromoléculas. Además, ciertos metabolitos potencian la acción de antimicrobianos conocidos o interfieren en factores de virulencia como la formación de biofilms y la comunicación celular por quorum-sensing. Debido a la creciente resistencia antimicrobiana, los extractos naturales, ricos en múltiples moléculas bioactivas, representan una alternativa prometedora, ya que su diversidad favorece efectos sinérgicos y reduce la probabilidad de aparición de resistencia. En este contexto, la presente tesis exploró microorganismos del suelo, del intestino de insectos y asociados a plantas, así como metabolitos de plantas, como fuentes de nuevos antimicrobianos. Se evaluó su efecto frente a patógenos clínicamente relevantes (incluyendo bacterias del grupo ESKAPE y levaduras del género Candida) y fitopatógenos de importancia agrícola, tanto en estado planctónico como en forma de biofilms. Los resultados obtenidos revelaron una destacada actividad frente a distintos microorganismos, reforzando el potencial de los metabolitos naturales, particularmente actuando en conjunto, como base para el desarrollo de nuevas estrategias antimicrobianas. El manuscrito de esta tesis contiene 4 capítulos. El primer capítulo brinda una introducción general al tema y los objetivos. El segundo aborda la obtención de extractos a partir de cultivos microbianos y el relevamiento de la actividad antimicrobiana y antibiofilm. El capítulo tercero se centra en los estudios de compuestos antimicrobianos y antibiofilm a partir de plantas nativas, incluyendo el estudio de algunos mecanismos de acción y el estudio fitoquímico de los metabolitos responsables, así como su relación con la actividad antibiofilm. En el capítulo cuarto se desarrolla la discusión general de los resultados obtenidos en la tesis, sus conclusiones y perspectivas.