La Paratuberculosis, también conocida como Enfermedad de Johne es una enfermedad entérica crónica producida por una bacteria: Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map), caracterizada en bovinos por diarrea crónica, debilidad, perdida de peso, hipoproteinemia y muerte. Actualmente se la asocia con una enteritis en humanos, enfermedad de Crohn, habiéndose aislado el Map de biopsias de intestino de pacientes con esa enfermedad. La seroprevalencia puede ser asociada a varios factores: tamaño del rodeo, condiciones ambientales, cuidados con el ternero, manejo de vaquillonas preñadas, prácticas de manejo y eliminación del estiércol. El objetivo de este estudio es determinar la seroprevalencia de la Paratuberculosis en rodeos lecheros de Florida y Colonia, mediante un muestreo serológico transversal y evaluar la asociación con prácticas de manejo a través de un estudio de casos y controles analizados en un modelo de regresión logística. La estimación de la seroprevalencia proyectada a la población bajo estudio fue de 5,6% ± 1,3 y un 70,2% ± 8,1 de los establecimientos resultaron con al menos un animal seropositivo. Mediante un modelo multivariable de regresión logística se encontró que el número de vacas en ordeño y la variable correspondiente a si en el área de parto encierran o tratan animales enfermos presentaba una tendencia a estar asociada a la seroprevalencia. La distancia de la fuente de agua de bebida al estercolero presentó una asociación positiva con la seroprevalencia. Se destaca el alto número de establecimientos con al menos un animal seropositivo, mientras que la seroprevalencia es similar a la encontrada en la mayoría de los estudios realizados en el mundo.