En los últimos años, la preocupación por las pérdidas de colonias de abejas Apis mellifera ha crecido en todo el mundo. En Uruguay, estas pérdidas alcanzan el 20-30% anual, siendo las infecciones por plagas y patógenos una de las principales causas. El objetivo de este trabajo fue realizar un relevamiento a nivel nacional de las principales plagas y patógenos que afectan a las abejas melíferas. En otoño-invierno de 2021 se muestrearon 100 colonias de todo el país, seleccionadas de forma representativa según la densidad de colonias por departamento. Se analizó la presencia, prevalencia y distribución del ácaro Varroa destructor y diferentes virus ARN (ABPV, BQCV, CBPV, DWV, IAPV, KBV, SBV) en abejas nodrizas; los hongos Nosema apis y Nosema ceranae y el tripanosomátido Lotmaria passim en abejas pecoreadoras, y la bacteria Paenibacillus larvae en miel. Para la detección y/o cuantificación de los patógenos se emplearon metodologías estándar (conteo directo, conteo en cámara de Neubauer en microscopio, cultivo microbiológico, PCR, multiplex PCR y RT-qPCR). N. ceranae, V. destructor y L. passim presentaron las prevalencias más altas (63, 62 y 60% respectivamente), y a continuación los virus DWV (30,6%), SBV (26,5%), CBPV (24,5%) y BQCV (22,4%). Finalmente, P. larvae presentó una prevalencia de 11% y el virus ABPV 6,1%. No se detectó la presencia de N. apis ni de los virus IAPV o KBV. Estos resultados muestran que los principales patógenos están presentes y ampliamente distribuidos en Uruguay, y a la vez resalta la importancia de los monitoreos para alertar sobre la situación sanitaria y el ingreso de nuevas amenazas.