Reactividad de los persulfuros biológicos
Supervisor(es): Alvarez, Beatriz - Cuevasanta, Ernesto
Resumen:
Los persulfuros (RSSH) cumplen roles fundamentales en procesos de biosíntesis, catabolismo y señalización. Derivan de los tioles (RSH) y se han propuesto como transductores de la señalización celular mediada por el sulfuro de hidrógeno (H2S). Los persulfuros poseen una química muy versátil; son especies ácidas y actúan como nucleófilos en su forma aniónica (RSS−) y como electrófilos cuando están protonados (RSSH). No obstante, las propiedades químicas de los persulfuros están escasamente caracterizadas. Este trabajo buscó contribuir a la comprensión de sus funciones biológicas mediante el estudio de sus propiedades básicas. Específicamente, se propuso estudiar la acidez y reactividad de persulfuros con relevancia biológica, tanto de bajo peso molecular como proteicos. Se observó que los persulfuros de bajo peso molecular no pueden ser aislados en medio acuoso debido a su alta reactividad. La incubación de disulfuros en medio alcalino llevó a la formación de persulfuros, y aunque no resultó conveniente para prepararlos en el laboratorio, puso de manifiesto sesgos que pueden ocurrir en el método de cianólisis fría, una técnica frecuentemente usada para cuantificar persulfuros. En cambio, las reacciones de disulfuros con concentraciones subestequiométricas de H2S resultaron útiles para producir persulfuros de bajo peso molecular y fueron utilizadas para estudiar su acidez y reactividad. Se adaptaron métodos de HPLC basados en la derivatización con monobromobimano que permitieron cuantificar la concentración de persulfuro de glutatión generada por ambas estrategias.Se estudiaron seis persulfuros de bajo peso molecular, incluyendo los derivados de glutatión y cisteína. Los persulfuros resultaron ser más ácidos que los tioles correspondientes, con valores de pKa de 4.6 a 6.3, y presentaron mayor reactividad nucleofílica que la esperada para los tiolatos de igual basicidad, proporcionando evidencia del efecto alfa en los persulfuros (aumento de la nucleofilia debido a la presencia de un átomo adyacente con alta densidad electrónica). Adicionalmente, se trabajó con dos enzimas humanas de la vía de oxidación de H2S que forman intermediarios persulfuros en su ciclo catlítico, la sulfuro quinona óxidorreductasa (SQR) y la rodanesa. Los resultados indican que la acidez de los persulfuros es modulada por los entornos proteicos, pues la SQR persulfurada tuvo un pKa de 7.8 ± 0.2. Por su parte, la rodanesa persulfurada presentó un pKa de 9.38 ± 0.04, probablemente debido a un residuo crítico del sitio activo y no al persulfuro en sí mismo. Por último, se comenzó a evaluar la viabilidad de desarrollar biosensores basados en la reactividad de los persulfuros de la rodanesa y la 3-mercaptopiruvato azufretransferasa (MST), obteniendo resultados prometedores con la MST de Leishmania major. En suma, en este trabajo se sentaron fundamentos sólidos sobre los persulfuros, basados en principios termodinámicos y cinéticos, que se espera que contribuyan a la comprensión de sus roles biológicos.
2023 | |
Persulfuros Sulfuro de hidrógeno Efecto Alfa Proteínas |
|
Español | |
Universidad de la República | |
COLIBRI | |
https://hdl.handle.net/20.500.12008/42639 | |
Acceso abierto | |
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dc.description.tableofcontents.es.fl_txt_mv | Agradecimientos -- Resumen en español -- Resumen en inglés -- Lista de abreviaturas -- Introducción -- 1.1. Generalidades de los persulfuros -- 1.2. Roles fisiológicos de los persulfuros -- 1.2.1. Persulfuros como potenciales transductores de la señalización mediada por H2S -- 1.2.2. Persulfuros como intermediarios en biosíntesis -- 1.2.3. Persulfuros como intermediarios en el catabolismo del H2S -- 1.3. Formación de persulfuros -- 1.3.1. Reacciones que dependen directamente de H2S --1.3.2. Reacciones que dependen indirectamente de H2S -- 1.3.3. Reacciones independientes de H2S -- 1.4. Propiedades químicas de los persulfuros -- 1.4.2. Nucleofilia -- 1.4.3. Oxidación -- 1.4.4. Electrofilia -- 1.4.5. Desproporcionación -- 1.4.6. Interacción con metales y metaloproteínas -- 1.5. Métodos de detección -- 1.5.1. Absorbancia -- 1.5.2. Cianólisis fría -- 1.5.3. Reacción con triarilfosfinas -- 1.5.4. Reducción y liberación de H2S. -- 1.5.5. Reacción con FDNB -- 1.5.6. Agentes alquilantes y espectrometría de masas -- 1.5.7. Sondas fluorogénicas -- 1.5.8. Métodos para estudios proteómicos de persulfuros -- 1.6. Modelos de persulfuros utilizados en este trabajo -- 1.6.1. Persulfuros de bajo peso molecular -- 1.6.2. Persulfuros proteicos -- 1.7. Aplicaciones de la química de los persulfuros para el desarrollo de biosensores -- 2. Objetivos -- 2.1. Objetivo general -- 2.2. Objetivos específicos -- 2.2.1. Propiedades bioquímicas de los persulfuros de bajo peso molecular -- 2.2.2. Propiedades bioquímicas de los persulfuros proteicos -- 2.2.3. Aplicaciones de la reactividad de los persulfuros -- 3. Resultados y discusión -- 3.1. Artículo 1. Los disulfuros forman persulfuros a pH alcalino, lo que puede generar sobreestimaciones en el método de la cianólisis fría -- 3.1.1. Antecedentes del artículo -- 3.1.2. Resultados y discusión -- 3.1.3. Conclusiones -- 3.1.4. Contribución personal en el artículo -- 3.2. Artículo 2. Acidez y reactividad nucleofílica de GSSH -- 3.2.1. Resultados y discusión -- 3.2.2. Conclusiones -- 3.2.3. Contribución personal en el artículo -- 3.3. Artículo 3. Acidez de los persulfuros y su modulación por los entornos proteicos en la SQR y la rodanesa -- 3.3.1. Resultados y discusión -- 3.3.2. Conclusiones -- 3.3.3. Contribución personal en el manuscrito -- 3.4. Oxidación de roGFP2 por azufretransferasas -- 3.4.1. Objetivos -- 3.4.2. Materiales y métodos -- 3.4.3. Resultados y discusión -- 3.4.4. Conclusiones y perspectivas -- 4. Discusión global, conclusiones y perspectivas – Anexos -- Anexo I. Disulfides form persulfides at alkaline pH leading to potential overestimations in the cold cyanolysis method -- Anexo II. Acidity and nucleophilic reactivity of glutathione persulfide ........ 155 Anexo III. Acidity of persulfides and its modulation by the protein environments in sulfide quinone oxidoreductase and thiosulfate sulfurtransferase -- Anexo IV. Autorización de coautores para realizar una tesis por compendio de artículos -- Anexo V. Actividades adicionales durante el desarrollo de la tesis -- Bibliografía |
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Específicamente, se propuso estudiar la acidez y reactividad de persulfuros con relevancia biológica, tanto de bajo peso molecular como proteicos. Se observó que los persulfuros de bajo peso molecular no pueden ser aislados en medio acuoso debido a su alta reactividad. La incubación de disulfuros en medio alcalino llevó a la formación de persulfuros, y aunque no resultó conveniente para prepararlos en el laboratorio, puso de manifiesto sesgos que pueden ocurrir en el método de cianólisis fría, una técnica frecuentemente usada para cuantificar persulfuros. En cambio, las reacciones de disulfuros con concentraciones subestequiométricas de H2S resultaron útiles para producir persulfuros de bajo peso molecular y fueron utilizadas para estudiar su acidez y reactividad. Se adaptaron métodos de HPLC basados en la derivatización con monobromobimano que permitieron cuantificar la concentración de persulfuro de glutatión generada por ambas estrategias.Se estudiaron seis persulfuros de bajo peso molecular, incluyendo los derivados de glutatión y cisteína. Los persulfuros resultaron ser más ácidos que los tioles correspondientes, con valores de pKa de 4.6 a 6.3, y presentaron mayor reactividad nucleofílica que la esperada para los tiolatos de igual basicidad, proporcionando evidencia del efecto alfa en los persulfuros (aumento de la nucleofilia debido a la presencia de un átomo adyacente con alta densidad electrónica). Adicionalmente, se trabajó con dos enzimas humanas de la vía de oxidación de H2S que forman intermediarios persulfuros en su ciclo catlítico, la sulfuro quinona óxidorreductasa (SQR) y la rodanesa. Los resultados indican que la acidez de los persulfuros es modulada por los entornos proteicos, pues la SQR persulfurada tuvo un pKa de 7.8 ± 0.2. Por su parte, la rodanesa persulfurada presentó un pKa de 9.38 ± 0.04, probablemente debido a un residuo crítico del sitio activo y no al persulfuro en sí mismo. Por último, se comenzó a evaluar la viabilidad de desarrollar biosensores basados en la reactividad de los persulfuros de la rodanesa y la 3-mercaptopiruvato azufretransferasa (MST), obteniendo resultados prometedores con la MST de Leishmania major. En suma, en este trabajo se sentaron fundamentos sólidos sobre los persulfuros, basados en principios termodinámicos y cinéticos, que se espera que contribuyan a la comprensión de sus roles biológicos.Submitted by Cabrera Jeniffer (jenikana@gmail.com) on 2024-02-26T17:44:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 25790 bytes, checksum: 489f03e71d39068f329bdec8798bce58 (MD5) TD_Benchoam.pdf: 16831144 bytes, checksum: 693863bc1e39abebd3158bab5871bea8 (MD5)Made available in DSpace by Luna Fabiana (fabiana.luna@seciu.edu.uy) on 2024-02-26T17:51:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 25790 bytes, checksum: 489f03e71d39068f329bdec8798bce58 (MD5) TD_Benchoam.pdf: 16831144 bytes, checksum: 693863bc1e39abebd3158bab5871bea8 (MD5) Previous issue date: 2023Agradecimientos -- Resumen en español -- Resumen en inglés -- Lista de abreviaturas -- Introducción -- 1.1. Generalidades de los persulfuros -- 1.2. Roles fisiológicos de los persulfuros -- 1.2.1. Persulfuros como potenciales transductores de la señalización mediada por H2S -- 1.2.2. Persulfuros como intermediarios en biosíntesis -- 1.2.3. Persulfuros como intermediarios en el catabolismo del H2S -- 1.3. Formación de persulfuros -- 1.3.1. Reacciones que dependen directamente de H2S --1.3.2. Reacciones que dependen indirectamente de H2S -- 1.3.3. Reacciones independientes de H2S -- 1.4. Propiedades químicas de los persulfuros -- 1.4.2. Nucleofilia -- 1.4.3. Oxidación -- 1.4.4. Electrofilia -- 1.4.5. Desproporcionación -- 1.4.6. Interacción con metales y metaloproteínas -- 1.5. Métodos de detección -- 1.5.1. Absorbancia -- 1.5.2. Cianólisis fría -- 1.5.3. Reacción con triarilfosfinas -- 1.5.4. Reducción y liberación de H2S. -- 1.5.5. Reacción con FDNB -- 1.5.6. Agentes alquilantes y espectrometría de masas -- 1.5.7. Sondas fluorogénicas -- 1.5.8. Métodos para estudios proteómicos de persulfuros -- 1.6. Modelos de persulfuros utilizados en este trabajo -- 1.6.1. Persulfuros de bajo peso molecular -- 1.6.2. Persulfuros proteicos -- 1.7. Aplicaciones de la química de los persulfuros para el desarrollo de biosensores -- 2. Objetivos -- 2.1. Objetivo general -- 2.2. Objetivos específicos -- 2.2.1. Propiedades bioquímicas de los persulfuros de bajo peso molecular -- 2.2.2. Propiedades bioquímicas de los persulfuros proteicos -- 2.2.3. Aplicaciones de la reactividad de los persulfuros -- 3. Resultados y discusión -- 3.1. Artículo 1. Los disulfuros forman persulfuros a pH alcalino, lo que puede generar sobreestimaciones en el método de la cianólisis fría -- 3.1.1. Antecedentes del artículo -- 3.1.2. Resultados y discusión -- 3.1.3. Conclusiones -- 3.1.4. Contribución personal en el artículo -- 3.2. Artículo 2. Acidez y reactividad nucleofílica de GSSH -- 3.2.1. Resultados y discusión -- 3.2.2. Conclusiones -- 3.2.3. Contribución personal en el artículo -- 3.3. Artículo 3. Acidez de los persulfuros y su modulación por los entornos proteicos en la SQR y la rodanesa -- 3.3.1. Resultados y discusión -- 3.3.2. Conclusiones -- 3.3.3. Contribución personal en el manuscrito -- 3.4. Oxidación de roGFP2 por azufretransferasas -- 3.4.1. Objetivos -- 3.4.2. Materiales y métodos -- 3.4.3. Resultados y discusión -- 3.4.4. Conclusiones y perspectivas -- 4. Discusión global, conclusiones y perspectivas – Anexos -- Anexo I. Disulfides form persulfides at alkaline pH leading to potential overestimations in the cold cyanolysis method -- Anexo II. Acidity and nucleophilic reactivity of glutathione persulfide ........ 155 Anexo III. Acidity of persulfides and its modulation by the protein environments in sulfide quinone oxidoreductase and thiosulfate sulfurtransferase -- Anexo IV. Autorización de coautores para realizar una tesis por compendio de artículos -- Anexo V. Actividades adicionales durante el desarrollo de la tesis -- Bibliografía253 p.application/pdfesspaUdelar. FQLas obras depositadas en el Repositorio se rigen por la Ordenanza de los Derechos de la Propiedad Intelectual de la Universidad de la República.(Res. Nº 91 de C.D.C. de 8/III/1994 – D.O. 7/IV/1994) y por la Ordenanza del Repositorio Abierto de la Universidad de la República (Res. Nº 16 de C.D.C. de 07/10/2014)info:eu-repo/semantics/openAccessLicencia Creative Commons Atribución - No Comercial - Sin Derivadas (CC - By-NC-ND 4.0)PersulfurosSulfuro de hidrógenoEfecto AlfaProteínasReactividad de los persulfuros biológicosTesis de doctoradoinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionreponame:COLIBRIinstname:Universidad de la Repúblicainstacron:Universidad de la RepúblicaBenchoam Altman, DayanaAlvarez, BeatrizCuevasanta, ErnestoUniversidad de la República (Uruguay). 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