Siendo Chile un país con un mayor nivel de desigualdad en la distribución de los ingresos, alcanza en la prueba de desempeño escolar de PISA 2006 resultados similares en promedio pero menos desiguales que Uruguay. Este trabajo pretende evaluar en qué medida los sistemas educativos de ambos países contribuyen a la equidad en la educación, una de las dimensiones fundamentales de las capacidades humanas. Para ello se construye una función de producción de capacidades educativas a partir de los resultados alcanzados por los estudiantes de 15 años en la prueba de PISA 2006, corrigiendo el sesgo de selección de debido a que ese estudio no considera dentro de su universo a quienes desertaron del sistema educativo o aún se encuentran en primaria. Se estiman indicadores de la desigualdad de las capacidades educativas y se estima en qué magnitud inciden los factores socio-económicos y los escolares en dicha desigualdad.