Solanum commersonii es un pariente silvestre de los cultivos (CWR) y tiene utilidad para el mejoramiento genético de la papa. Para analizar la producción de gametos no reducidos (2n) y la diversidad genética, se colectaron poblaciones en Uruguay. Mediante citometría de flujo se identificó poblaciones formadas por individuos 2x, 3x y mezcla de ambos niveles de ploidía. En las últimas se analizó la microesporogénesis y sólo en una población se identificó polen 2n en muy baja proporción (un individuo con 3 % y otro con 1 %), aunque en todas se identificó díadas y tríadas. La meiosis fue altamente irregular, con 39 a 42% de husos paralelos en metafase II (posible mecanismo de formación de gametos 2n en estas poblaciones). En los individuos 3x, las irregularidades indicaron una alta homología entre los tres genomios, con lo cual se comportan como si fueran autopoliploides. En los tres marcadores SSR amplificados de los ocho ensayados, el número de alelos varió entre 6 y 9, con valores promedios de PIC = 0,67. El análisis de coordenadas principales no detectó estructura poblacional, salvo una separación de las poblaciones del litoral y el sur. Se identificaron hasta cinco clones por población y los ramets de un clon tendieron a agruparse sin mezclarse con los de otro clon. Los rangos de dispersión clonal fueron desde 3,90 m a 83,45 m. Se observó que las barreras geográficas (ej.: cursos de agua) tienden a separar clones diferentes de una misma población. La diversidad genética encontrada mostró que los 3x no se separan genéticamente de los 2x. Al momento de realizar una colecta, los ramets deben estar separados entre sí por lo menos unos 50 m para capturar la mayor variabilidad genética de S. commersonii, prestando atención a las alteraciones antrópicas y las barreras naturales.