Los virus de herpesvirus equino (EHV) 1 y 4 y el virus de Influenza Equina (EIV), provocan cuadros clínicos respiratorios, aborto, neumonitis neonatal de los potros, o mieloencefalopatía y ocasionan importantes pérdidas socioeconómicas a la industria equina. El presente estudio plantea estimar la prevalencia, identificar los tipos de EHVs que circulan en el Uruguay y determinar el nivel de protección serológica frente a la infección por EIV en los equinos de deporte en el Uruguay. Se comprueba que el virus EHV 1 se encuentra ampliamente distribuido en la población de equinos de deporte en nuestro país, con una prevalencia estimada del 29% (IC 95%; 27-31%) y la misma está asociada a factores como la raza y la vacunación contra la Rinoneumonitis Equina (RE), p<0,05. Los estudios moleculares confirman la presencia de la infección por EHV 1 y evidencian por primera vez la detección de EHV 4 y una alta frecuencia de detección de la variante neuropatogénica (G2254/D752) de herpesvirus equino 1 (EHV 1) en Uruguay. Se observó una baja cobertura de vacunación contra la Gripe Equina (23%), y bajo nivel de protección virológica y clínica ((27% y 35% respectivamente) medidos por la prueba de SRH. Los mismos están asociados a equinos que no tienen vacunación vigente, a la raza árabe y cuarto de milla, a equinos menores a 2 años de edad y a los machos castrados.