La variabilidad interindividual en la respuesta y toxicidad a tratamientos es un problema muy común y serio, que causa preocupación y puede ser responsable de la reducción de la dosis o discontinuación del tratamiento. La Farmacogenética busca predecir dicha variabilidad, mediante el análisis y uso de la información genética individual o poblacional. El metotrexate(MTX), análogo estructural del ácido fólico, ha sido un fármaco altamente efectivo en tratamientos oncológicos y autoinmunes. Sin embargo presenta una gran variabilidad interindividual en su respuesta farmacológica y toxicidad. Una de las causas de dicha variabilidad es la existencia de polimorfismos en los genes que codifican proteínas transportadoras y dianas del MTX. El objetivo general de este trabajo fue contribuir al conocimiento para un diseño de una terapia personalizada con MTX. Como forma de realizar una aproximación a una vía tan compleja, desde el ingreso del MTX hasta su blanco de acción en la célula, nos propusimos evaluar la distribución y analizar la asociación entre la toxicidad y eficacia del tratamiento y los polimorfismos en los genes que codifican para los transportadores: de folato reducido (SLC19A1) G80A y de solutos de aniones orgánicos de la familia 1B1 (SLCO1B1) T521C; así como también en los genes que codifican para las enzimas involucradas en la actividad del MTX: 5,10- metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR) C677T y A1298C, variación en el número de copias de 28 pb en el gen timidilato sintasa (TYMS) y dihidrofolato reductasa (DHFR) C- 1610G/T, C-680A, A-317G y el polimorfismo que consiste en una inserción deleción de 19 pb. El grupo de estudio consistió en 41 pacientes adultos uruguayos con leucemia linfoide aguda (LLA) y linfoma no-Hodgkin (LNH) agresivo tratados con un protocolo de poliquimioterapia que incluyera mediana y/o altas dosis de MTX y en un grupo control de 55 adultos uruguayos voluntarios sanos. De dichos pacientes se relevaron los parámetros clínicos y de laboratorio obtenidos del seguimiento de la terapia.