Un programa de mejoramiento genético de tomate (Solanum lycopersicum L.) debe utilizar el conocimiento y la tecnología disponible en el desarrollo de estrategias eficientes para resolver diferentes problemas en la cadena de valor. En este trabajo partimos de cuatro fenotipos de interés comercial: i) tolerancia a ToCV (Crinivirus) ii) resistencia al herbicida Metribuzin iii) aumento del contenido de vitamina-C y iv) hábito de planta erecto (hoja erecta). Aplicando una estrategia de trabajo que integra herramientas a nivel fenotípico, molecular y genómico, nos propusimos avanzar en la identificación de genes candidatos. La estrategia comprendió los siguientes pasos: definición de la característica, estudio de su base genética, localización primaria del factor en el mapa físico, identificación de genes candidatos y validación genética. Se confirmó la presencia de cuatro alelos con efecto principal para los fenotipos descritos: cvt, mtz y Vtc y Erl. Para cvt y mtz se generó información suficiente para lograr su localización primaria. Para Vtc se avanzó en la identificación de dos genes candidatos que deberán ser confirmados y validados. Erl fue relacionado con un gen aún no caracterizado al que denominamos SlTAC1. La estrategia aplicada permitió avanzar con éxito en la identificación de genes candidatos, generando información que facilita el uso en mejoramiento de nuevos caracteres de interés para la producción de tomate. A la vez, se plantean nuevas hipótesis de investigación para complementar y profundizar el conocimiento generado.